A Reitoria da Universidade Federal de Sergipe é o órgão diretivo e executivo máximo da Universidade, ao qual compete administrar os recursos humanos, financeiros e materiais da Universidade, visando alcançar seus objetivos e o aperfeiçoamento e desenvolvimento de suas atividades de ensino, pesquisa e extensão e promover o relacionamento e permanente intercâmbio da Universidade com a comunidade em geral com as instituições congêneres em particular.

Organicamente é constituída pela seguinte estrutura organizacional:

• Gabinete do Reitor (GR);
• Gabinete do Vice-Reitor (GVR);
• Pró-Reitoria de Graduação (PROGRAD);
• Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa (POSGRAP);
• Pró-Reitoria de Extensão e Cultura (PROEX);
• Pró-Reitoria de Assuntos Estudantis (PROEST);
• Pró-Reitoria de Administração (PROAD);
• Pró-Reitoria de Planejamento e Orçamento (PROPLAN);
• Pró-Reitoria de Gestão de Pessoas (PROGEP); 
• Superintendência de Tecnologia da Informação e Comunicação (STIC); 
• Superintendência de Infraestrutura (INFRAUFS);
• Superintendência de Indicadores de Desempenho Institucional (SIDI);
• Superintendência de Comunicação (SECOM);
• Diretoria de Projetos e Estruturas Físicas (DOFIS);
• Coordenações Executivas: Coordenação de Concursos e Vestibulares (CCV), Coordenação de Ações Afirmativas (CAAF) e Coordenação dos Observatórios Sociais (OBSERVO);
• Procuradoria Geral (PGE);
• Corregedoria Geral (CORREGUFS);
• Ouvidoria Geral (OUVIDORIAUFS);
• Órgãos Suplementares: Biblioteca Central (BICEN), Centro de Ensino Superior a Distância (CESAD), Colégio de Aplicação (CODAP), Hospitais Universitários (HUs) e Hospital Veterinário Universitário (HVU), e
• Comissões Permanentes: Comissão de Ética (CE), Comissão Interna de Supervisão (CIS), Comissão Permanente de Pessoal Docente (CPPD) e Comissão Permanente de Cadastramento de Firmas e Julgamento de Licitações (CPCFJL).

Localização

Prédio da Reitoria, 1º andar, Cidade Universitária Prof. José Aloísio de Campos, Av. Marcelo Deda Chagas, s/n, Bairro Rosa Elze, São Cristóvão/SE.